ՓԵՆ Հայաստանը հետխորհրդային տարածաշրջանում հիմնադրված առաջին ՓԵՆ կենտրոնն էր, որը հիմնադրվել է 1991 թվականին գրող Գևորգ Էմինի կողմից։ Հետագա տարիներին կազմակերպությունը ղեկավարել են անվանի գրական թարգմանիչ Աննա Հակոբյանը և մարդու իրավունքների պաշտպան Միքայել (Միկա) Դանիելյանը, որոնք երկուսն էլ նպաստել են կազմակերպության առաքելության և միջազգային ներգրավվածության ձևավորմանը։
Ներկայիս ՓԵՆ Հայաստանյան կենտրոնը վերակազմավորվել է 2017 թվականին՝ շարունակելով իր դերը խոսքի ազատության խթանման, գրողներին աջակցելու և Հայաստանի մասնակցությունը համաշխարհային գրական և մշակութային փոխանակման նախագծերում ամրապնդելու գործում։